Zeynep Tunuslu iki kez evlenmiştir. 1. 1993 yılında müzisyen Uzay Heparı ile evlenmiş ve 1994 yılında Heparı'nın vefatıyla bu evlilik sona ermiştir. 2. 2001 yılında fotoğrafçı Ahmet Ağaoğlu ile evlenmiş, ancak bu evlilik de aynı yıl içinde boşanmayla sonuçlanmıştır.