Yunanistan'ın mavi haç bayrağının nedeni, ulusal bayrağın tasarımında yer alan sembollerin taşıdığı anlamlar ile ilgilidir. - Mavi ve beyaz renkler, Yunanistan'ın milli renkleridir ve mavi, gökyüzünü ve denizi; beyaz ise Yunan bağımsızlık mücadelesinin saflığını sembolize eder. - Haç, Hristiyanlık dinini temsil eder. - Dokuz yatay çizgi, Yunan sloganı "Eleftheria i Thanatos" (İstiklal ya da Ölüm) kelimelerinin toplam hece sayısından gelmektedir.