Germiyanoğulları Beyi II. Yakub Bey, 80 yaşını geçtikten sonra 1428 yılında Kütahya'da vefat etmiştir. Ölümüyle ilgili herhangi bir suikast veya hastalık bilgisi mevcut belgelerde yer almamaktadır. Yakub Bey'in ölümü, Edirne'de bir aylık misafirlikten sonra memleketine dönerken maddi zorluklar yaşaması ve bu nedenle II. Murad'dan yardım istemek zorunda kalmasıyla ilişkilendirilmiştir.