Willem Dafoe'nun en iyi filmi konusunda kesin bir görüş yoktur, ancak bazı eleştirmenler ve kaynaklar tarafından öne çıkarılan yapımlar şunlardır: 1. "Platoon" (1986): Oliver Stone'un savaş draması, Dafoe'nun canlandırdığı Elias karakteriyle dikkat çeker ve ona ilk Oscar adaylığını kazandırmıştır. 2. "The Last Temptation of Christ" (1988): Martin Scorsese'nin yönettiği bu filmde Dafoe, İsa karakterini canlandırarak derin bir performans sergilemiştir. 3. "The English Patient" (1996): Anthony Minghella'nın yönettiği bu epik romantik dramda Dafoe, Caravaggio rolünü üstlenmiştir. 4. "Spider-Man" (2002): Sam Raimi'nin süper kahraman filminde Dafoe, Green Goblin karakterini unutulmaz bir şekilde canlandırmıştır. 5. "The Lighthouse" (2019): Robert Eggers'ın yönettiği bu siyah-beyaz gerilim filmi, Dafoe'nun oyunculuk dehasını bir kez daha gözler önüne sermiştir.