Katie Holmes ve Tom Cruise'un ayrılmasının ana nedeni, Scientology tarikatıyla ilgilidir. Tom Cruise, eşi Katie Holmes'un ve kızları Suri'nin de tarikat üyesi olmasını istemiş, ancak Katie Holmes bu isteği reddetmiştir. Tom Cruise, 2013 yılında yaptığı bir açıklamada, Holmes'un boşanma kararının Scientology ile ilgili olduğunu kabul etmiş, ancak "Çiftler boşandığında böyle şeyler olur" diyerek konu hakkında daha fazla yorum yapmamıştır.