Katie Holmes ve Tom Cruise'un ayrılmasının nedeni, Katie Holmes'un Scientology tarikatına karşı olması ve kızının da bu tarikatla ilişkilendirilmesini istememesi olarak gösterilmektedir. Tom Cruise ise tarikatın en üst düzey üyelerinden biri olarak, Katie Holmes'un ve kızının Scientology'ye katılmasında ısrar ediyordu.