"Şifrelerin Peşinde İstanbul", üç arkadaşın (Nehir, Efe ve Cafer) İstanbul'un önemli mekânlarına gizlenen şifreleri bulup çözmeye çalışmalarını ve bu süreçte yaşadıkları maceraları anlatır. Hikayede, karakterler şifreleri çözerek zamanı geri getirmeye çalışır. Kitap, okuyucuyu işe dahil eden bulmacalar içerir ve farklı dönemlere ait önemli kişi ve yerlere değinilir.