Piksel sanat için kullanılabilecek bazı programlar şunlardır: 1. Aseprite: Pixel çizim ve animasyon yapmak için tercih edilen bir uygulamadır. 2. Piskel: Web tabanlı, ücretsiz bir pixel art programıdır ve simetrik çizimler ile GİF olarak indirme imkanı sunar. 3. GrafX2: Açık kaynak kodlu, ücretsiz bir program olup, oyun grafikleri ve piksel sanatsal çizimler için kullanılabilir. 4. Krita: Açık kaynak bir piksel çizim programı olup, illüstratörler ve animatörler tarafından sıkça tercih edilir. 5. Cosmigo Pro Motion: Profesyonel pixel çizim programı, hem bilgisayar hem de mobil oyunlar için uygundur. 6. Adobe Photoshop: Çok amaçlı bir resim düzenleme uygulaması olup, piksel art grafikler oluşturmak için de kullanılabilir.