Endonezya'nın kırmızı ve beyaz bayrak kullanmasının nedeni, bu renklerin 13. yüzyılda kurulmuş olan Majapahit İmparatorluğu'nun bayrağına dayanmasıdır. Endonezya dilinde "Sang Saka Merah Putih" ("Kırmızı ve Beyaz") olarak bilinen bayrak, 17 Ağustos 1945'te Endonezya'nın bağımsızlığını ilan etmesiyle birlikte ulusal sembol olarak kabul edilmiştir. Bayraktaki renklerin anlamları şu şekildedir: Kırmızı. Beyaz. Bazı modern kaynaklar iki rengi Endonezya mutfağının temel taşları olan hurma şekeri ve pirinçle de ilişkilendirmektedir.