Ebubekir Şahin, Medyabar'da herhangi bir pozisyonda çalışmamaktadır. Şahin, 23 Ocak 2019 tarihinden itibaren Radyo ve Televizyon Üst Kurulu (RTÜK) Başkanı olarak görev yapmaktadır .
Ayrıca, 12 Haziran 2020 tarihli Genel Kurul Toplantısında Türkiye Halk Bankası AŞ Yönetim Kurulu Üyeliğine seçilmiştir ve Türkiye Wushu Kung Fu Federasyonu İcra Kurulu üyesidir .