Tarım ve Orman Bakanlığı'na bağlı genel müdürlükler şunlardır: Gıda ve Kontrol Genel Müdürlüğü; Bitkisel Üretim Genel Müdürlüğü; Hayvancılık Genel Müdürlüğü; Balıkçılık ve Su Ürünleri Genel Müdürlüğü; Tarım Reformu Genel Müdürlüğü; Tarımsal Araştırmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğü; Su Yönetimi Genel Müdürlüğü; Avrupa Birliği ve Dış İlişkiler Genel Müdürlüğü; Personel Genel Müdürlüğü; Hukuk Hizmetleri Genel Müdürlüğü. Ayrıca, Rehberlik ve Teftiş Başkanlığı, Strateji Geliştirme Başkanlığı, Tütün ve Alkol Dairesi Başkanlığı, Destek Hizmetleri Dairesi Başkanlığı, Eğitim ve Yayın Dairesi Başkanlığı, Bilgi Teknolojileri Genel Müdürlüğü, Basın ve Halkla İlişkiler Müşavirliği ve Özel Kalem Müdürlüğü de bakanlığa bağlı birimlerdir.