Sedat Peker, suç örgütü kurma, tehdit, iş yeri kurşunlama, yaralama ve hürriyeti tahdit gibi suçlardan dolayı 14 yıl 5 ay 10 gün hapis cezasına çarptırıldığı için cezaevinde yattı .
Bu ceza, 12 Mart 2005 tarihinde başlayan Kelebek Operasyonu kapsamında alınmıştır .