Mehmet Karadeniz'in görevden alınma nedeni, Gaziantep 2. Ağır Ceza Mahkemesi tarafından "Silahlı Terör Örgütüne Üye Olma" suçundan aldığı 6 yıl 3 ay 15 gün hapis cezası olarak açıklanmıştır .
Ayrıca, Şanlıurfa Cumhuriyet Başsavcılığı tarafından yürütülen devam eden bir soruşturma kapsamında da İçişleri Bakanlığı tarafından geçici bir tedbir olarak görevden uzaklaştırılmıştır .