Manisa Valiliği'nde bulunan bazı birimler şunlardır: Yatırım İzleme ve Koordinasyon Başkanlığı. Özel Kalem Müdürlüğü. İl Basın ve Halkla İlişkiler Müdürlüğü. İl İdare Kurulu Müdürlüğü. İdare ve Denetim Müdürlüğü. İl Planlama ve Koordinasyon Müdürlüğü. İl Sosyal Etüt ve Proje Müdürlüğü. İl Yazı İşleri Müdürlüğü. Bilgi İşlem Şube Müdürlüğü. Hukuk İşleri Şube Müdürlüğü. Ayrıca, Manisa Valiliği'nde bulunan bazı ilçe kaymakamlıkları ve AB proje ofisleri de şunlardır: Ahmetli Kaymakamlığı. Akhisar Kaymakamlığı. Alaşehir Kaymakamlığı. Demirci Kaymakamlığı. Gölmarmara Kaymakamlığı. Köprübaşı Kaymakamlığı. Kula Kaymakamlığı. Salihli Kaymakamlığı. Sarıgöl Kaymakamlığı. Saruhanlı Kaymakamlığı. Selendi Kaymakamlığı. Soma Kaymakamlığı. Şehzadeler Kaymakamlığı. Turgutlu Kaymakamlığı. Yunusemre Kaymakamlığı.