İsmail Hakkı Pekin, işletme yönetimi konusunda Vatan Partisi ve medya grubu ile oluşan fikir ayrılıkları nedeniyle istifa etmiştir .
Pekin, 6 Ağustos 2017 tarihinde yaptığı açıklamada, "Ben gördüğüm lüzum üzerine istifa ettim ve istifa dilekçemi Vakıf Başkanına gönderdim" diyerek görevden alınmadığını, kendi isteğiyle ayrıldığını belirtmiştir . Aynı gün Vatan Partisi'nden de istifa ettiğini ifade etmiştir .