Estonya, bağımsızlığını korumak ve toprak bütünlüğünü sağlamak amacıyla ordu kurmuştur. Estonya ordusunun kurulma nedenlerinden bazıları şunlardır: Egemenliğin korunması. Toprak bütünlüğünün korunması. Anayasa düzeninin ve kamu güvenliğinin sağlanması. Ayrıca, Estonya ordusu, yurtdışındaki görevlerde yer almak ve ulusal toprakların korunmasına yönelik operasyonlar yürütmek amacıyla da geliştirilmektedir.