Askeri doktorlar, sivilde de çalışabilirler, ancak bu süreç belirli prosedürlere tabidir .
Kura ile askeri kadroya atanan sivil doktorlar, Milli Savunma Bakanlığı ile Sağlık Bakanlığı arasında yapılan protokole göre, ihtiyaç duyulan kadrolara görevlendirilebilirler . Ayrıca, askeri doktorların özel hastane açma yasakları da bulunmaktadır .