Avrupa Birliği'nin en güçlü kurumu konusunda kesin bir yanıt vermek zor olsa da, Avrupa Komisyonu ve Avrupa Parlamentosu genellikle en güçlü kurumlar arasında gösterilir. Avrupa Komisyonu, Birliğin yürütme organı olarak, AB müktesebatını, bütçeyi ve programları uygulamaktan ve idari denetimden sorumludur. Avrupa Parlamentosu ise, AB'nin doğrudan seçilmiş yasama organı olup, yasama yetkileri ve bütçe üzerindeki etkisiyle güçlü bir kurumdur.