Karayolları Genel Müdürlüğünde aşağıdaki birimler bulunmaktadır: Merkez Teşkilatı: 1. Genel Müdür ve genel müdür yardımcıları. 2. Hizmet birimleri: Etüt, Proje ve Çevre Dairesi Başkanlığı, Araştırma ve Geliştirme Dairesi Başkanlığı, Yol Yapım Dairesi Başkanlığı ve diğerleri. 3. Danışma ve denetim birimleri: Teftiş Kurulu Başkanlığı, Hukuk Müşavirliği, Strateji Geliştirme Dairesi Başkanlığı. 4. Yardımcı hizmet birimleri: Personel Dairesi Başkanlığı, Destek Hizmetleri Dairesi Başkanlığı, Bilgi Teknolojileri Dairesi Başkanlığı. Taşra Teşkilatı: 1. Bölge müdürlükleri, başmühendislikler, şube müdürlükleri ve şeflikler. 2. İkmal Müdürlüğü ve Atölye Müdürlüğü.