Tanganika Gölü'nde balık popülasyonunun azalmasının başlıca nedenleri arasında küresel ısınma ve aşırı balıkçılık yer almaktadır .
Küresel ısınma, sıcaklığa duyarlı balık türlerinin yaşam alanlarını sınırlamış ve balık popülasyonlarında önemli düşüşlere yol açmıştır . Ayrıca, 1980'lerde patlayan endüstriyel balıkçılık da gölün ekosistemine zarar vermiş ve daha sonra çökmüştür .