Pigme tavşanlar, yok olma tehlikesiyle karşı karşıya çünkü: 1. İklim Değişikliği: Pigme tavşanların diyetinin büyük bir kısmı adaçayına bağlıdır ve bu bitki, iklim değişikliği nedeniyle orman yangınları ve kuraklık nedeniyle azalmaktadır. 2. Habitat Kaybı: Batı Amerika Birleşik Devletleri'ndeki yoğun adaçayı büyümesi, gevşek toprak ve tünel kazma gereksinimleri gibi çevresel faktörler, yaşam alanlarını daraltmaktadır. 3. Üreme Yetersizliği: Pigme tavşanlar, her yıl sadece bir kez ve 8 forma kadar yavru yapabilmektedir, bu da popülasyonlarının artmasını engellemektedir.