Mağaraların içinde çeşitli oluşumlar ve unsurlar bulunabilir: Doğal şekiller: Sarkıt, dikit ve sütunlar gibi kalsiyum karbonatın çökelmesiyle oluşan şekiller. Tarihi kalıntılar: Çanak çömlek, taş aletler ve kemikler gibi arkeolojik kalıntılar. Canlılar: Mağara semenderi ve mağara kereviti gibi tamamen ortama bağımlı yaşayan canlılar. İnsan yapımı unsurlar: Depo, sığınak veya yer altı şehri gibi yapay yapılar. Ayrıca, bazı mağaralar travertenler, şifalı su havuzları veya doğal maden suyu çeşmeleri gibi özelliklere de sahip olabilir.