Misk öküzlerinin yok olmasının başlıca nedenleri şunlardır: Avlanma: Avrupalı yerleşimciler tarafından ateşli silahların kullanılmaya başlanması ve kaşifler ile balina avcıları tarafından yiyecek ve sıcak postları için avlanmaları, misk öküzlerinin neslini neredeyse tükenme noktasına getirmiştir. Habitat kaybı: Tuzakçılar tarafından binlerce misk öküzünün sıcak postları için öldürülmesi de popülasyonun azalmasına katkıda bulunmuştur. İklim değişikliği: Son buzul çağının sonlarına doğru, iklim koşullarının değişmesi, misk öküzlerinin popülasyonunu olumsuz etkilemiştir. Günümüzde misk öküzü nüfusu, koruma çabaları sayesinde artış göstermektedir.