Marmara Adası'nın kendisi tehlikeli değildir, ancak Marmara Denizi'nde denize girmenin tehlikeli olabileceği durumlar vardır. Özellikle müsilaj (deniz salyası) görülen bölgelerde denize girmek önerilmez 5. Müsilaj, denizdeki atık ve kirlilik nedeniyle oluşan biyolojik ve kimyasal bir yapıdır ve cilt hastalıklarına, ağız yoluyla alındığında ise ishalli hastalıklara yol açabilir 5.

Ayrıca, deprem riski de dikkate alınmalıdır. Japon deprem uzmanı Yoshinori Moriwaki, Marmara Bölgesi'nde Bursa, Silivri, Çanakkale adalarının güneyi ve Marmara boğazının 20 kilometre güneye gittiği yerlerde büyük deprem riski olduğunu belirtmiştir 3.

Genel olarak, Marmara Adası'nın doğal güzellikleri ve temiz havası ile bilinen bir tatil destinasyonu olduğunu, ancak deniz ve deprem gibi bazı risklerin de bulunduğunu söylemek mümkündür.