Madagaskar 3: Avrupa'nın En Çok Arananları filminde yer alan hayvanlar şunlardır: Aslan Alex; Zebra Marty; Zürafa Melman; Su aygırı Gloria; Lemur Mort. Ayrıca, filmde kaplan Vitaly, jaguar Gia, deniz aslanı Stefano ve penguen Kowalski gibi karakterler de bulunmaktadır.