Köpek balıklarının en büyük düşmanı insan olarak kabul edilir 45.

Bunun nedenleri arasında, köpek balıklarının insanlar tarafından avlanması ve yüzgeçleri, derileri, çeneleri gibi vücut kısımlarının ticari değeri olması yer alır 45.

Ayrıca, köpek balıklarının doğal düşmanlarından biri de katil balina (Orca) olarak bilinir 35.

Diğer bir düşman olarak mıknatıslar da sayılabilir; yapılan bir araştırmaya göre, köpek balıkları manyetik ve elektriksel alanları algılayabilen özel sensörlere sahiptir ve bu nedenle mıknatıslardan uzak dururlar 1.