Japonya'nın iklimi, coğrafi konumu ve dağlık yapısı nedeniyle oldukça çeşitlidir. Genel olarak dört ana iklim tipi görülür: 1. Okyanus İklimi: Japonya'nın batı kıyısında ve kuzey bölgelerinde hakimdir, ılıman ve nemli bir hava özelliği taşır. 2. Kıtasal İklim: İç bölgelerde ve kuzeydoğuda etkilidir, yazlar sıcak, kışlar ise soğuk ve kar yağışlıdır. 3. Tropikal İklim: Güney adalarda, özellikle Okinawa ve çevresinde görülür, yazlar sıcak ve nemli, kışlar ılımandır. 4. Subtropikal İklim: Güney kıyılarında ve özellikle Kyushu adasında yaygındır, yazları sıcak ve nemli, kışları ılımandır. Ayrıca, Japonya'da muson rüzgarlarının etkisi de belirgin olup, bu rüzgarlar yaz yağmurlarını etkiler.