Ergene Havzası, Trakya Bölgesi'nde yer alması ve Türkiye'nin en önemli tarım alanlarından biri olması nedeniyle önemlidir. Havzanın önemi şu noktalarda da ortaya çıkmaktadır: Sanayi faaliyetleri: Bölgede yoğun sanayi faaliyetleri bulunması, ekonomik kalkınmaya katkı sağlar. Su kaynakları: Ergene Nehri ve yan kolları, havzanın en önemli yerüstü su kaynaklarıdır ve bölgedeki ticari ürünlerin sulanmasında kullanılır. Çevre sorunları: Havzada yaşanan nehir kirliliği, su kalitesini düşürmüş ve tarımsal üretimde verim kayıplarına yol açmıştır.