Çimlenmede yüzde kaç kayıp olacağı, çeşitli faktörlere bağlı olarak değişebilir. Çimlenme kaybı, tohumun türüne, yaşına, depolama koşullarına ve çevresel faktörlere bağlı olarak önemli ölçüde farklılık gösterebilir .
Çimlenme oranını hesaplamak için, çimlenen tohum sayısının toplam tohum sayısına bölünmesi ve sonucun 100 ile çarpılması gerekir . Örneğin, 10 tohumdan 8'i filizlenirse, çimlenme oranı %80 olacaktır .
Çimlenme sırasında oluşabilecek bazı kayıplar, tohumun uygun çevre koşullarına (su, sıcaklık, oksijen) yerleştirilmemesi veya tohumun içsel uyku halinden çıkmaması gibi nedenlerden kaynaklanabilir .