Çilekte kök çürüklüğü birden fazla etkenin bir araya gelmesiyle oluşur. Bu etkenler arasında en sık görülenler: Rhizoctonia solani, Fusarium oxysporum, Macrophomina phaseoli ve Pythium sp. gibi funguslar; Coniothyrium hirum, Hainessia sp., Alternaria alternata ve Cylindrocarpon sp.; Toprak suyunun birikmesi ve toprağın oksijen azlığı; Yüksek sıcaklık (yaklaşık 30°C ve üzeri). Ayrıca, yetiştiricilik hataları ve taban suyunun yüksek olması da kök çürüklüğüne yol açabilir.