Çayır köpeklerinin yok edilmesinin başlıca nedenleri şunlardır: İnsan faaliyetleri: Çiftçiler ve hayvan çiftliği sahipleri, çayır köpeklerini ürünlere zarar verdikleri gerekçesiyle yok etmektedir. Zehirlenme: ABD Tarım Bakanlığı, çayır köpeklerini "tarım zararlısı" olarak görmekte ve bu nedenle zehirlemektedir. Doğal düşmanların yok olması: Beyaz yerleşimciler, çayır köpeklerinin doğal düşmanlarını yok etmişlerdir, bu da onların sayılarının artmasına ve yaşam alanlarının daha elverişli hale gelmesine yol açmıştır. Ayrıca, kentsel ve tarımsal gelişim de çayır köpeklerinin yaşam alanlarını daraltarak yok olmalarına neden olmaktadır.