Atlarda sıkça görülen bazı hastalıklar şunlardır: Kolik: Atların karınlarında sancı hissetmesi durumudur. Tetanoz: Yara veya kesiklerden giren bakterinin neden olduğu bir hastalıktır. Dermatit: Atlarda cilt iltihapları ve alerjik reaksiyonlardır. Paraziter enfeksiyonlar: Solucanlar, keneler ve bitler gibi parazitler atların sağlığını etkileyebilir. Şarbon: Bakteriyel bir enfeksiyon olup ateş, titreme ve iştah kaybı gibi belirtilerle kendini gösterir. Ensefalit: Atlarda ve katırlarda yaygın olan ağır bir viral enfeksiyondur. Ruam: Başta at, merkep ve katır olmak üzere, insan ve hayvanat bahçelerinde yaşayan yabani hayvanlarda görülen zoonoz bir hastalıktır. Pazartesi hastalığı (azotüri): Yoğun karbonhidrat ile beslenen atlarda, dinlenme günlerinde yoğun enerjili yemlerle beslenilmesi sonucu görülen bir kas hastalığıdır.