Balıklar, derileri ve solungaçları yoluyla idrar ve dışkılarını dışarı atarlar . Akvaryuma idrar yapmaları, doğal bir süreç olup, balıkların vücut atıklarını dışarı atma yöntemidir .
Ancak, akvaryum suyunda idrar rengi ve kokusu oluşması, amonyum seviyesinin yükseldiğini gösterebilir . Amonyum, yiyecek atıkları ve pisliklerden açığa çıkar ve düzenli dip temizliği yapılmadığında birikir . Bu durum, balıklar için zehirli olabilir ve amonyum zehirlenmesine yol açabilir .