At çiftleşmesi, doğal ve kontrollü olmak üzere iki şekilde gerçekleşir. Doğal çiftleşme: Kur yapma: Erkek at, dişiyi cezbetmek için çeşitli davranışlar sergiler. Çiftleşme: Dişi at, çiftleşmeye hazır olduğunu kuyruğunu kaldırarak gösterir ve erkek at binmeye devam eder. Kontrollü çiftleşme: Manuel yöntem: Aygır ve kısrak küçük bir padokta bir araya getirilir. Biçme yöntemi: Her aygır için 25 kısrak belirlenir ve çiftleşme, vahşi doğadaki gibi gerçekleşir. Pişirme yöntemi: Aygır, üreme dönemi boyunca birkaç kısrakla birlikte tutulur. Suni tohumlama: Veteriner, kısrağın rahim ağzına meni enjekte eder. Çiftleşme öncesi, hem aygır hem de kısrak veteriner tarafından muayene edilmelidir. Atların çiftleşmesi genellikle 15-20 dakika sürer.