Bitkili akvaryumda dış filtre kullanılması önerilir. Bu filtrede aşağıdaki filtre malzemeleri kullanılmalıdır: 1. Seramik Halkalar: Biyolojik filtrasyon için faydalıdır, faydalı bakterilerin yaşaması için geniş bir yüzey alanı sağlar. 2. Sünger: Mekanik filtrasyon yaparak büyük partikülleri ve yem artıklarını süzer. 3. Aktif Karbon: Kimyasal filtrasyon için kullanılır, suyun içindeki toksinleri ve kötü kokuları emer. 4. Lava Taşı veya Biyolojik Toplar: Ekstra biyolojik filtrasyon sağlar. 5. Filtre Elyafı: Mekanik filtrasyonun son aşamasında, küçük partikülleri toplar. Ayrıca, şelale tipi filtreler de bitkili akvaryumlarda tercih edilebilir, çünkü bu filtreler hem mekanik hem de biyolojik filtrasyonu bir arada sunar.