Yılmaz Erdoğan'ın en iyi filmi konusunda kesin bir görüş yoktur, ancak bazı kaynaklar Kelebeğin Rüyası'nı en iyi filmi olarak değerlendirmektedir. Kelebeğin Rüyası, Yılmaz Erdoğan'ın hem yönetmenliğini hem de senaristliğini üstlendiği, Zonguldaklı genç şairler Rüştü Onur ve Muzaffer Tayyip Uslu'nun gerçek hayat hikayesine dayanan bir dram filmidir. Diğer kaynaklar ise Bir Zamanlar Anadolu'da ve Organize İşler gibi filmleri öne çıkarmaktadır. En iyi film değerlendirmesi kişisel zevklere göre değişebilir.