Unicorn Akademisi, sıradan bir genç olan Sophia'nın, Tekboynuz Adası'ndaki sihirli akademide fantastik canlılar hakkında bilgi edinmesini ve karanlık bir gücün tekboynuz sihrini yok etme girişimine karşı verdiği mücadeleyi anlatıyor. Sophia ve diğer yeni öğrenciler, büyülü güçlerini ortaya çıkarmak için bir tekboynuzla bağ kurmalıdır. Dizi, sınıf dengesi, arkadaşlık, rekabet ve tipik genç yaşamının zorlukları gibi temaları işliyor.