Manhunt: Unabomber dizisinin 2. sezonu, FBI ajanı Jim Fitzgerald'ın, seri bombacı Unabomber olarak bilinen Ted Kaczynski'yi yakalama çabalarını konu alır. Bu sezonda, Fitzgerald, Unabomber'ın zihniyetini anlamak için elindeki delilleri analiz eder ve tehlikeli bir oyunun içine adım atar. 2. sezonun, 1. sezonla bağlantılı olmayan farklı bir hikaye anlattığı da belirtilmiştir.