Ultimate Spider-Man serisi, Marvel Comics'in uzun soluklu Spider-Man çizgi roman serisinin modernize edilmiş bir yeniden anlatımı olarak tanımlanmaktadır. Hikaye, Peter Parker adlı karakterin etrafında dönmektedir: - Orphaned at the age of six, Peter Parker is an outcast and withdrawn teenaged science prodigy. - Genetik yapısı değiştirilmiş bir örümceğin ısırığı ile çeşitli süper insan güçleri kazanır. - Bir hırsızı durdurabileceği halde durdurmaz ve o hırsız Peter'ın amcası Ben'i öldürür. - Amcasının ölümünden suçluluk duyar ve kendisi için dikilen özel kostümü giyerek suçla savaşmaya başlar. Peter, Spider-Man kimliği altında, New York'ta hem süper insan hem de suçlu tehditlerle mücadele ederken, aynı zamanda lise hayatı, ilişkileri ve ailesinin sorumluluklarıyla da başa çıkmaya çalışır.