Teşkilat dizisinin 4. sezon finali şu şekilde bitti: - Ömer Atmaca sağlık durumunun kötüleşmesi nedeniyle hastaneye kaldırıldı. - Çetin Neslihan'ı kaçırıp Şirket'e teslim edince ortalık karıştı. - Ekip, Çetin'i yeniden yakalamak için operasyona başladı. - Şirket, Türk Kuvvet Ordusu hakkında bilgi edinmek için Neslihan'a işkence yöntemleri uygulasa da onu konuşturmayı başaramadı. - Ekip, önce Neslihan'ı Şirket'in elinden aldı, sonra da Ömer'in hayatı için panzehirin peşine düştü. - Çetin, Ömer ve Neslihan'ın karşısına çıkıp Ömer'i vurdu ve Ömer hayatını kaybetti.