Trollhunters'ın 3. sezonunda Jim Lake ve arkadaşları, son bir çabayla kötü trol Gunmar ve cadı kraliçe Morgana'yı yenmeye çalışırlar. Sezonda yaşanan bazı önemli olaylar: Merlin'in Tanıtımı: Büyücü Merlin, takıma katılır ve onlara rehberlik eder. Yeni Karakterler: Krel ve Aja adlı iki yeni öğrenci Arcadia'ya gelir ve hikayeye dahil olurlar. Aile Dramı: Jim'in annesiyle olan ilişkisi gelişir ve bir aile dramı yaşanır. Trollmarket'in Savunması: Trollmarket'i ve tüm troll dünyasını tehdit eden bir düşman ortaya çıkar. Sezon, hem duygusal hem de aksiyon dolu anlarla dolu bir finalle sona erer.