Tarihin Arka Odası programının bitmesinin birkaç nedeni vardır: 1. Reyting Sorunları: Pelin Batu, programda reyting için "laf sokulmaya" başlandığını ve bu durumun kendisini rahatsız ettiğini belirtmiştir. 2. Program Partneri ile Anlaşmazlık: Murat Bardakçı ve yeni program partneri Ayşe Özek Karasu arasındaki anlaşmazlıklar, programın sona ermesine yol açmıştır. 3. Kanal Yönetimi ile Gerilim: Bardakçı, kanal yönetiminin program için gereken parayı veto etmesi nedeniyle programı bırakmıştır.