"Süper Baba" dizisinin en güzel bölümü konusunda kesin bir görüş yoktur, çünkü dizi toplamda 4 sezon ve 137 bölüm sürmüştür. Ancak, dizinin bazı bölümleri izleyiciler tarafından özellikle hatırlanmaktadır: 39. bölüm: Dizinin önemli bir dönüm noktası olan bu bölümde, Fikret'in hapse girmesi ve Deniz'in ona olan hislerini açıklaması yer almaktadır. "Barışma" adlı bölüm: Bu bölümde, Aksu ailesinin kiracı olarak yaşadığı ahşap konağın satılma ihtimali ve aile içi ilişkiler ele alınmıştır. "Çevre Mücadelesi" adlı bölüm: İpek karakterinin, fabrikanın atıklarını dereye vermesi üzerine başlattığı çevre mücadelesi işlenmiştir.