Spy Kids 3-D: Game Over (Çılgın Çocuklar 3: Oyun Bitti) filmi, serinin üçüncü filminde, Carmen ve Juni Cortez'in maceralarını devam ettiriyor. Bu sefer, Juni, bilgisayar oyun dünyasına giren ve orada kaybolan bir diğer casus olan Carmen'ı kurtarmakla görevlendirilir. Filmin konusu şu şekilde özetlenebilir: İkinci filmdeki olaylardan 3 yıl sonra Juni Cortez, OSS'den emekli olmuş ve artık sakin bir şekilde yaşamakta, küçük bir maaşla da olsa özel dedektif olarak çalışmaktadır. Bir gün, OSS'nin eski başkanı Başkan Devlin onunla temasa geçer ve ona kız kardeşi Carmen Cortez'in yanlış giden bir görevden sonra kayıp olduğunu bildirir. Carmen'in Oyuncakçı tarafından yakalandığını açıklayan organizasyon tarafından siber uzayda hapsedilen eski bir OSS muhbiri, o zamandan beri, rakipsiz Seviye 5'e ulaşan oyuncular aracılığıyla siber uzaydan kaçmak için kullanmayı planladığı sanal gerçeklik tabanlı bir video oyunu olan Game Over'ı yaratmıştır. Juni oyuna girmeyi, Carmen'i kurtarmayı ve kazanmak için sadece on iki saat verilen oyunu kapatmayı kabul eder. Grup, Juni'nin, grubu yöneten Toymaker tarafından serbest bırakılan Carmen'i bulduğu 4. Seviyeye gelir. Carmen, büyükbabasının yanlarında olduğunu fark eder ve Juni'ye, büyükbabalarının tekerlekli sandalye kullanmasının nedeninin Oyuncakçı olduğunu söyler. Lav dolu bir vadiye giden bir haritayı takip ederler. Grup, lav boyunca sörf yaparak ilerler. OSS, Oyuncakçı ve Valentin arasındaki geçmişi öğrenir. Valentin'in intikam alabileceğinden korkan Donnagon, onların Seviye 5'e ulaşmalarını engellemeye çalışır, ancak başarısız olur. Lavlara düşerler ve bunun zararsız olduğunu keşfederler. Seviye 5'in kapısını buldukları bir mağaraya ulaşırlar. Seviye 5'in kapısının dışında, Carmen onlara sadece 5 dakikalarının kaldığını söyler. Diğer oyuncular, Carmen ve Juni'nin aldatıcı olduğunu düşünmeye başlayınca ve Rez, Juni'ye oyunu geri vermekle tehdit edince, gerçek "Guy" belirir