"Sniper Elite 5" oyununun konusu, 1944 yılında Fransa'da geçmektedir. Hikaye, SOE keskin nişancısı Karl Fairburne'un, Amerikalıların Fransa'da bir sahil başı ve iniş noktası elde etmelerine yardımcı olmak için bir Ordu Ranger taburuna katılmasını konu alır. Fairburne, direniş irtibat görevlisi Charlie Barton ile birlikte çalışırken, bir denizaltılarının yok edildiğini ve Möller liderliğindeki birliklerin, "Kraken Operasyonu"na dahil olduklarını öğrenir. Fairburne, Saint Nazaire'deki U-bot sığınağını yok ederek "Kraken" projesini durdurmayı başarır ve Möller'i öldürerek görevini tamamlar.