Ninja Turtles 3 filminin iptal edilmesinin sebebi, "Teenage Mutant Ninja Turtles: Out of the Shadows" filminin gişede beklenen başarıyı yakalayamaması olarak gösterilmiştir 345.

Filmin yapımcısı Andrew Form, "Out of the Shadows"un ilk filmin yarısı kadar gelir elde etmesinin, bir üçleme için kırmızı bayrak olduğunu belirtmiştir 5. Form, "Biz bunun nedenini anlamaya çalıştık ama bir türlü anlayamadık. Gerçekten anlayamıyoruz" diyerek filmin neden başarısız olduğuna dair bir fikirlerinin olmadığını ifade etmiştir 45.

Form ayrıca, izleyicilere yeni ve taze bir şey sunmak gerektiğini, sadece kanona ait karakterler eklemenin yeterli olmadığını da dile getirmiştir 45.

Buna rağmen, yapımcı Form, Ninja Turtles'ın başka bir filmde yeniden kullanılma olasılığını tamamen kapatmadığını da belirtmiştir 5.