Megan Fox'un en iyi filmi konusunda kesin bir görüş birliği yoktur, ancak bazı eleştirmenler ve kaynaklar tarafından öne çıkarılan yapımlar şunlardır: 1. "Transformers" (2007): Michael Bay'in yönettiği bu film, Megan Fox'un dünya çapında tanınmasını sağlamış ve aksiyon, bilim kurgu türlerinde başarılı bulunmuştur. 2. "Jennifer's Body" (2009): Korku ve komedi ögelerini bir arada sunan bu film, zamanla kült statüsü kazanmıştır. 3. "Teenage Mutant Ninja Turtles" (2014): Ninja Kaplumbağalar'ın modern bir uyarlaması olan bu filmde Megan Fox, gazeteci April O'Neil karakterini canlandırmıştır. Diğer beğenilen Megan Fox filmleri arasında "Till Death" (2021) ve "Expendables 4" (2023) da yer almaktadır.