"Miss Pilot" dizisinin konusu, ailesiyle birlikte bir restoran işleten, dürüst ve iyi kalpli Haru Tezuka'nın pilot olma hayaliyle havacılık dünyasına giriş yapmasını ve yaşadığı zorlukları anlatır. Haru, ANA (All Nippon Airways) adlı havayolu şirketinin sınavını zar zor geçer ve pilot olma yolunda yoğun bir eğitime başlar.