Behzat Ç. dizisinin 2. sezonunda yaşanan bazı olaylar şunlardır: Kesik Parmak Cinayetleri: Suna'nın, erkek şiddetine karşı bu cinayetleri işlediği ortaya çıkar ve intihar eder. Savcı Esra'nın Evliliği: Behzat Ç., Savcı Esra ile evlenir ve Şule'yi kızı olarak kabul eder. Yeni Karakterler: Narkotik komiseri Suna (Mine Tugay), psikolog Funda (Yasemin Öztürk) ve cinayet eski başkomiseri Aziz (Ahmet Uğurlu) diziye dahil olur. Savaş'ın Dönüşü: Savcı Esra'nın eskiden görüşmediği kardeşi Savaş (Elvin Beşikçioğlu) diziye katılır. Özel Hayatlardaki Değişimler: Harun ve Eda çıkmaya başlar, Şevket boşanır ve Funda'nın ajan olduğunu öğrenir. Ercüment Çözer'in Dönüşü: Ercüment Çözer, Avrupa'dan döner ve Savcı Esra'yı içeri tıktırır. Savcı Esra'nın Ölümü: Sezon finalinde Savcı Esra ölür. 2. sezon, 13 Kasım 2011'de yayınlanan 39. bölümle başlayıp, 17 Haziran 2012'de yayınlanan "Akıntıya Karşı..." isimli 69. bölümle tamamlanmıştır.