"Maymunlar Cehennemi 3: Savaş", Sezar'ın liderliğindeki maymunlar ile Albay McCullough komutasındaki insanlar arasındaki acımasız savaşı konu alır. Sezar, büyük kayıplar veren maymunların intikamını almak için efsanevi bir yolculuğa çıkar. İki ırkın geleceği, bu yüzleşmeye bağlıdır. Film, aynı zamanda insan ırkının kendi kibri nedeniyle doğayı sömürüp kendi sonunu hazırlamasını da işler.